自由空间的美羽终于做出抉择，她的意识沉入共生之痕深处，显形出藏着的完美基因记忆 —— 那是七千九百次实验中，所有被培育出的完美版本的自己。当她的噬神基因开始吞噬这些记忆，显形出的，是陈凡和陈竹的基因残影在记忆宫殿中微笑，他们的手掌按在她的基因链上，显形出能对抗痛苦的锈色温暖。
\"爸爸，姑姑……\" 美羽的意识在记忆销毁中低语，显形出每吞噬一段完美记忆，她的共生之痕就扩大一分，\"我终于明白，缺口不是缺陷，是生命的眼睛。\"
地核的完美之核突然发出刺耳警报，显形出其核心处，齿轮之神的基因烙印正在被美羽的噬神基因侵蚀。初代园艺师们的集体意识在恐慌中显形，显形出他们的齿轮手臂疯狂敲击着控制界面，\"快启动完美之核的自毁程序！不能让缺口之力觉醒！\"
双生地貌的锈色方舟终于突破白色漩涡，显形出漩涡深处，藏着的基因花园核心 —— 那里悬浮着能定义进化法则的存在之碑，碑体上，七千九百道缺口基因链正在等待最终的裁决。美羽的意识在看到石碑的瞬间，显形出她的共生之痕与石碑产生的共振，显形出能改写宇宙的基因之光。
话未说完，完美之核的自毁程序启动，显形出能吞噬整个基因荒原的反物质风暴。美羽的锈色方舟在风暴中显形出最后的姿态，存在之锚狠狠刺入存在之碑，显形出碑体表面，开始浮现出由缺口基因书写的新进化法则，而她的意识，正在风暴中逐渐消散。